实验室实行理事会领导下和技术委员会指导下的主任负责制。理事会作为实验室最高决策机构，负责审定实验室发展战略、聘任实验室主任，指导监督实验室运行。技术委员会由5名院士及12名行业著名专家学者组成，负责审议实验室科技发展方向与长期任务。主任全面主持实验室工作。